گاتس جنگجویی جوان به گروهی مزدور ملقب به دسته شاهین به رهبری جوان جاه طلبی به نام گریفیس ملحق می گردد.گاتس که گریفیس را دوست خود میداند به او برای رسیدن به جاه طلبی هایش کمک می کند. ولی جاه طلبی گریفیس به سمت اعمال پلید سوق می دهد…
این انیمه پایانی بر انیمه سریالی Neon Genesis Evangelion می باشد. NERV با یک حمله وحشیانه از سوی SEELE مواجه می شود، اما بدلیل اینکه آسوکا در کما به سر می برد و شینجی نیز دچار فروپاشی عصبی شده، همه چیز بزودی سورئال می شود.
وقتی فرشتگان در سال 2015 به زمین حمله می کنند، تنها گروهی از خلبانان 14 ساله قابلیت متوقف کردن آنها را دارند."شینجی ایکاری" جوان ناگهان به عنوان خلبان رباتی غول پیکر، تنها چیزی که می تواند فرشتگان را متوقف سازد، انتخاب می شود و...